Tag Archives: Brownian motion

Моделирование эволюции морфологических признаков – макроэволюционный подход. Пример скриптаEstimating continuous trait evolution with Brownian motion and Ornstein–Uhlenbeck proccesses

При макроэволюционном сравнительном анализе очень часто возникает необходимость обработки большого числа филогенетических деревьев в батч-режиме: например, при тестировании различных гипотез относительно эволюции морфологических признаков (статья Smith, Harmon et al. 2011) или при анализе скорости диверсификации (статья Rabosky and Lovette, 2007). Кроме того, нередко морфологический или экологический признак, эволюция которого оценивается с помощью филогенетического сравнительного анализа,… Read More »

Введение в эволюционные модели. Скрытые замещения и модель Джукса-Кантора

Мы уже неоднократно в разных упражнениях на сайте ссылались на такое понятие, как эволюционная модель. В этом тексте мы начинаем рассказ о том, что же это значит. Все мы хорошо знаем, что существуют 4 нуклеотида, кодирующих ДНК. Кроме того, мы знаем, что эволюционный процесс на генетическом уровне – это череда случайных мутаций, то есть замен… Read More »